Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CELF1Q92879 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CELF1Q92879 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CELF1Q92879 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CELF1Q92879 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms