Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms