Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFYVE27Q5T4F4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFYVE27Q5T4F4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms