Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC122Q5T0U0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC122Q5T0U0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC122Q5T0U0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms