Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C4orf17Q53FE4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms