Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E2F4Q16254 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F4Q16254 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms