Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX2Q02962 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX2Q02962 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.1 ms