Protein–RNA interactions for Protein: P54868

HMGCS2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS2P54868 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGCS2P54868 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGCS2P54868 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGCS2P54868 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGCS2P54868 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms