Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ABCC1P33527 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC1P33527 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC1P33527 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC1P33527 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms