Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS4Y1P22090 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS4Y1P22090 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms