Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMSP20962 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMSP20962 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMSP20962 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMSP20962 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTMSP20962 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMSP20962 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMSP20962 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMSP20962 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTMSP20962 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMSP20962 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMSP20962 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMSP20962 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMSP20962 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMSP20962 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTMSP20962 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTMSP20962 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTMSP20962 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTMSP20962 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTMSP20962 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTMSP20962 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTMSP20962 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTMSP20962 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTMSP20962 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTMSP20962 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTMSP20962 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTMSP20962 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTMSP20962 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTMSP20962 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTMSP20962 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTMSP20962 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTMSP20962 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTMSP20962 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTMSP20962 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTMSP20962 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTMSP20962 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTMSP20962 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTMSP20962 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTMSP20962 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTMSP20962 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTMSP20962 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTMSP20962 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTMSP20962 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTMSP20962 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTMSP20962 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTMSP20962 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTMSP20962 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTMSP20962 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTMSP20962 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTMSP20962 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTMSP20962 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTMSP20962 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTMSP20962 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTMSP20962 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTMSP20962 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTMSP20962 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTMSP20962 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTMSP20962 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTMSP20962 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTMSP20962 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTMSP20962 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTMSP20962 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTMSP20962 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTMSP20962 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTMSP20962 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTMSP20962 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTMSP20962 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTMSP20962 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTMSP20962 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTMSP20962 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTMSP20962 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTMSP20962 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTMSP20962 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTMSP20962 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTMSP20962 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTMSP20962 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTMSP20962 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTMSP20962 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTMSP20962 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms