Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC182A6NF36 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC182A6NF36 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC182A6NF36 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC182A6NF36 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC182A6NF36 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms