Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A087X0B3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A087X0B3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A087X0B3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A087X0B3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms