Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP4B1Q9Y6B7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AP4B1Q9Y6B7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP4B1Q9Y6B7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP4B1Q9Y6B7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms