Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.04■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC47■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC46.97■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC46.95■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC46.95■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.11
DCAF1Q9Y4B6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
DCAF1Q9Y4B6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC46.84■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
DCAF1Q9Y4B6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
DCAF1Q9Y4B6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
DCAF1Q9Y4B6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms