Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAE1Q9UBE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAE1Q9UBE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAE1Q9UBE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms