Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOP53Q9NZM5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOP53Q9NZM5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms