Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VCX3BQ9H321 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCX3BQ9H321 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms