Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf49Q96NF6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C8orf49Q96NF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms