Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16BQ96JE7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC16BQ96JE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC16BQ96JE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms