Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUB1Q96FW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB1Q96FW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB1Q96FW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB1Q96FW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms