Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SIRT1Q96EB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SIRT1Q96EB6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SIRT1Q96EB6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SIRT1Q96EB6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SIRT1Q96EB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms