Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FSIP1Q8NA03 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FSIP1Q8NA03 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FSIP1Q8NA03 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FSIP1Q8NA03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms