Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL4BQ8N7F7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL4BQ8N7F7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms