Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LETMD1Q6P1Q0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LETMD1Q6P1Q0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms