Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CT47A1Q5JQC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CT47A1Q5JQC4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CT47A1Q5JQC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms