Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUSP6Q16828 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP6Q16828 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP6Q16828 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms