Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC85BQ15834 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC85BQ15834 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
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