Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAPTM4AQ15012 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAPTM4AQ15012 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAPTM4AQ15012 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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