Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1BQ14684 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1BQ14684 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP1BQ14684 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
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