Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERCC8Q13216 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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ERCC8Q13216 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERCC8Q13216 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ERCC8Q13216 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ERCC8Q13216 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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