Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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FAM3AP98173 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FAM3AP98173 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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FAM3AP98173 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FAM3AP98173 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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