Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H2P55055 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1H2P55055 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms