Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGIRP43119 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGIRP43119 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms