Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJC1P36383 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJC1P36383 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJC1P36383 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJC1P36383 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJC1P36383 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJC1P36383 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJC1P36383 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJC1P36383 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJC1P36383 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJC1P36383 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJC1P36383 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJC1P36383 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJC1P36383 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJC1P36383 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJC1P36383 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJC1P36383 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJC1P36383 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJC1P36383 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJC1P36383 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJC1P36383 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJC1P36383 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJC1P36383 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJC1P36383 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJC1P36383 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJC1P36383 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJC1P36383 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJC1P36383 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJC1P36383 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJC1P36383 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJC1P36383 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJC1P36383 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJC1P36383 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJC1P36383 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJC1P36383 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJC1P36383 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJC1P36383 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJC1P36383 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJC1P36383 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJC1P36383 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJC1P36383 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJC1P36383 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJC1P36383 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJC1P36383 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJC1P36383 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJC1P36383 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJC1P36383 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJC1P36383 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJC1P36383 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJC1P36383 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJC1P36383 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJC1P36383 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJC1P36383 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJC1P36383 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJC1P36383 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJC1P36383 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJC1P36383 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJC1P36383 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJC1P36383 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJC1P36383 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJC1P36383 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJC1P36383 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJC1P36383 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJC1P36383 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJC1P36383 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJC1P36383 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJC1P36383 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJC1P36383 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC1P36383 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC1P36383 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC1P36383 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC1P36383 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC1P36383 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJC1P36383 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC1P36383 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC1P36383 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC1P36383 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC1P36383 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC1P36383 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJC1P36383 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms