Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TAF1P21675 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF1P21675 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF1P21675 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF1P21675 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF1P21675 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TAF1P21675 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TAF1P21675 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TAF1P21675 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TAF1P21675 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TAF1P21675 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TAF1P21675 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1P21675 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1P21675 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1P21675 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1P21675 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TAF1P21675 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF1P21675 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF1P21675 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TAF1P21675 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1P21675 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1P21675 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1P21675 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TAF1P21675 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1P21675 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1P21675 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1P21675 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1P21675 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1P21675 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TAF1P21675 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF1P21675 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF1P21675 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF1P21675 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF1P21675 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF1P21675 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TAF1P21675 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1P21675 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1P21675 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1P21675 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TAF1P21675 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TAF1P21675 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
TAF1P21675 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF1P21675 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF1P21675 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF1P21675 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF1P21675 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TAF1P21675 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1P21675 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1P21675 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1P21675 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1P21675 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1P21675 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TAF1P21675 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF1P21675 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TAF1P21675 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF1P21675 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TAF1P21675 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1P21675 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1P21675 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1P21675 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1P21675 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TAF1P21675 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TAF1P21675 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TAF1P21675 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TAF1P21675 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TAF1P21675 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TAF1P21675 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TAF1P21675 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TAF1P21675 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1P21675 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TAF1P21675 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1P21675 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1P21675 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1P21675 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1P21675 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TAF1P21675 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1P21675 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1P21675 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms