Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT1P21579 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT1P21579 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT1P21579 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT1P21579 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT1P21579 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT1P21579 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT1P21579 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT1P21579 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT1P21579 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT1P21579 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT1P21579 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT1P21579 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT1P21579 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT1P21579 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYT1P21579 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYT1P21579 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT1P21579 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT1P21579 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT1P21579 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT1P21579 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT1P21579 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT1P21579 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT1P21579 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT1P21579 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT1P21579 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT1P21579 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT1P21579 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT1P21579 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT1P21579 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT1P21579 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYT1P21579 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYT1P21579 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYT1P21579 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYT1P21579 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYT1P21579 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT1P21579 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT1P21579 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT1P21579 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT1P21579 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT1P21579 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT1P21579 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT1P21579 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT1P21579 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT1P21579 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT1P21579 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT1P21579 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT1P21579 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT1P21579 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT1P21579 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT1P21579 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT1P21579 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT1P21579 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT1P21579 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT1P21579 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT1P21579 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT1P21579 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT1P21579 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT1P21579 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT1P21579 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT1P21579 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT1P21579 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms