Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL4A2P08572 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL4A2P08572 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A2P08572 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms