Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HLA-DOAP06340 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HLA-DOAP06340 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HLA-DOAP06340 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms