Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPN1P04843 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPN1P04843 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPN1P04843 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPN1P04843 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPN1P04843 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPN1P04843 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPN1P04843 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPN1P04843 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPN1P04843 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPN1P04843 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPN1P04843 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPN1P04843 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPN1P04843 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPN1P04843 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPN1P04843 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPN1P04843 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPN1P04843 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPN1P04843 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPN1P04843 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPN1P04843 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPN1P04843 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPN1P04843 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPN1P04843 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPN1P04843 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPN1P04843 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPN1P04843 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPN1P04843 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPN1P04843 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPN1P04843 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPN1P04843 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPN1P04843 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPN1P04843 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPN1P04843 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPN1P04843 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPN1P04843 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPN1P04843 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPN1P04843 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPN1P04843 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPN1P04843 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RPN1P04843 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RPN1P04843 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPN1P04843 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPN1P04843 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPN1P04843 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPN1P04843 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPN1P04843 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RPN1P04843 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPN1P04843 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPN1P04843 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPN1P04843 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPN1P04843 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPN1P04843 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPN1P04843 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPN1P04843 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPN1P04843 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPN1P04843 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPN1P04843 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPN1P04843 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPN1P04843 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPN1P04843 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPN1P04843 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPN1P04843 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPN1P04843 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPN1P04843 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RPN1P04843 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPN1P04843 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPN1P04843 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms