Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BBOX1O75936 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BBOX1O75936 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BBOX1O75936 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms