Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KERAO60938 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KERAO60938 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KERAO60938 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KERAO60938 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KERAO60938 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KERAO60938 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KERAO60938 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KERAO60938 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KERAO60938 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KERAO60938 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KERAO60938 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KERAO60938 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KERAO60938 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KERAO60938 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KERAO60938 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KERAO60938 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KERAO60938 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KERAO60938 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KERAO60938 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KERAO60938 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KERAO60938 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KERAO60938 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KERAO60938 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KERAO60938 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KERAO60938 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KERAO60938 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KERAO60938 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KERAO60938 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KERAO60938 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KERAO60938 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KERAO60938 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KERAO60938 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KERAO60938 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KERAO60938 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KERAO60938 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KERAO60938 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KERAO60938 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KERAO60938 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KERAO60938 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KERAO60938 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KERAO60938 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KERAO60938 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KERAO60938 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KERAO60938 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KERAO60938 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KERAO60938 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KERAO60938 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KERAO60938 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms