Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR2DO15514 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR2DO15514 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR2DO15514 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms