Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF12Q9Y4X4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF12Q9Y4X4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms