Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.39■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.38■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.38■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.38■■■■■ 6.78
NISCHQ9Y2I1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC57.36■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC57.36■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC57.35■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC57.35■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.35■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC57.35■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.35■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.35■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.34■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC57.34■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC57.33■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC57.33■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC57.33■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.31■■■■■ 6.77
NISCHQ9Y2I1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.29■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.28■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.27■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC57.26■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC57.26■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC57.26■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.25■■■■■ 6.76
NISCHQ9Y2I1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.25■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC57.24■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.24■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC57.24■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC57.23■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC57.22■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC57.22■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC57.21■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC57.21■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC57.2■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.2■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.2■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC57.2■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC57.2■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.2■■■■■ 6.75
NISCHQ9Y2I1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC57.18■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC57.17■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC57.17■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.17■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC57.16■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC57.16■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.15■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC57.15■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC57.14■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.13■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.13■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC57.13■■■■■ 6.74
NISCHQ9Y2I1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.12■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC57.12■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC57.1■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC57.09■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.08■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC57.08■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC57.08■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC57.08■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC57.07■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC57.06■■■■■ 6.73
NISCHQ9Y2I1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC57.05■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.05■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.03■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC57.03■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.03■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.03■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.03■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC57.03■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.02■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC57.01■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC57.01■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC57.01■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC57.01■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57■■■■■ 6.72
NISCHQ9Y2I1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC56.99■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.99■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC56.99■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC56.98■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC56.98■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC56.97■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.97■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.97■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC56.96■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.95■■■■■ 6.71
NISCHQ9Y2I1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.94■■■■■ 6.71
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