Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ1

SAGE1, Sarcoma antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE1Q9NXZ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SAGE1Q9NXZ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SAGE1Q9NXZ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SAGE1Q9NXZ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SAGE1Q9NXZ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms