Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REXO4Q9GZR2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REXO4Q9GZR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REXO4Q9GZR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms