Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM9Q9C026 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM9Q9C026 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM9Q9C026 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms