Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF7Q9BWX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF7Q9BWX1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF7Q9BWX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF7Q9BWX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms