Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms